More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2835 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  351  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  75.66 
 
 		 159 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  74.34 
 
 		 166 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  70.86 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  55.35 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 159 aa  170  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 222 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  46.99 
 
 		 222 aa  134  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  46.99 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  46.99 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  46.99 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  46.99 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  46.99 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  46.99 
 
 		 171 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 165 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 174 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 174 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 174 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  46.25 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0704  transcriptional regulator, AsnC family  45.45 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3640  transcriptional regulator, AsnC family  44.81 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3502  transcriptional regulator, AsnC family  44.16 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 155 aa  126  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 151 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  41.06 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 181 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 181 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 181 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 181 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 163 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 153 aa  124  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 171 aa  124  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  46.41 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0737  transcriptional regulator, AsnC family  43.51 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 157 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  43.59 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  43.59 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 156 aa  121  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 156 aa  121  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  43.92 
 
 		 176 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.74 
 
 		 156 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  43.24 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  43.24 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  39.47 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  43.59 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  43.95 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  40.52 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  41.98 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  46.41 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  44.81 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 159 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 169 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  40.88 
 
 		 172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 159 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0598  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>