More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0581 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5387  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 155 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138805  normal  0.471727 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  38.71 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  38.71 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  38.71 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  36.42 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  36.42 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  36.42 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  36.42 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  36.42 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.892509 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.1 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6006  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4270  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.34453  normal  0.84826 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  35.1 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4348  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4019  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814285  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3757  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349158  normal  0.199057 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4231  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0970255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 163 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 168 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0598  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1672  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.483706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 175 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1595  bkd operon transcriptional regulator  37.09 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 157 aa  103  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0800  putative leucine-responsive regulatory protein  37.09 
 
 		 164 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338493  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 159 aa  103  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1764  putative leucine-responsive regulatory protein  37.09 
 
 		 164 aa  103  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1107  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 164 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0665  putative leucine-responsive regulatory protein  37.09 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2393  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1184  bkd operon transcriptional regulator  37.09 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 154 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 198 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>