More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0598 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0598  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  338  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  44.74 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.67 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  43.33 
 
 		 156 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 156 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 155 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  43.14 
 
 		 158 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2701  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0065289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  39.87 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  39.87 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 222 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  44.24 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  44.24 
 
 		 222 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  44.24 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  44.24 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  44.24 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  44.03 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  44.24 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  44.24 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 153 aa  111  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 181 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 181 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  38 
 
 		 229 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 181 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 181 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.67 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  41.18 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3224  transcriptional regulator, AsnC family  44.2 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1405  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.55305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0703  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0327834  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0458  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.302522  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1509  transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0071225  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 152 aa  108  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  39.35 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  39.35 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  40.13 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 156 aa  107  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>