More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0458 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0458  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  357  5e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.302522  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  41.83 
 
 		 155 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 154 aa  127  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  40.91 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 155 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  39.47 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 161 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  38.82 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  38.82 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  38.82 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  38.82 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  39.62 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  38.82 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 153 aa  121  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 152 aa  121  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 202 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 155 aa  120  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  36 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  41.33 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0468  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.674302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.67 
 
 		 153 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.96 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  117  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 		 155 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 153 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.66 
 
 		 155 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2055  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.650647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 147 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1090  AsnC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  41.4 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  37.74 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  41.4 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1090  AsnC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4315  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169505  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  38.93 
 
 		 152 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 165 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1207  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371155  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  38.82 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1180  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0727  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 157 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  40.36 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 282 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 222 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  40.36 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  38.82 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  38.82 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  40.36 
 
 		 222 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 198 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  38.82 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  40.12 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  40.36 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  40.12 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  40.36 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>