More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2701 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2701  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  324  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0065289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5387  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138805  normal  0.471727 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  36.77 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 181 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.42 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 181 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 181 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 181 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  39.61 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0598  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  33.13 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  41.45 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 180 aa  110  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  34.21 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  35.95 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 218 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  34.64 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  33.55 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  35.29 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  32.7 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  31.36 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  31.93 
 
 		 168 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  31.36 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  31.36 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 163 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  31.93 
 
 		 168 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0569  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  31.93 
 
 		 222 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 222 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 159 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  34.19 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  34.19 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  35.9 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2964  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04743  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3224  transcriptional regulator, AsnC family  40.71 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>