More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3757 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4231  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  320  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0970255  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3757  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  320  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349158  normal  0.199057 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6006  AsnC family transcriptional regulator  99.36 
 
 
157 aa  318  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30036  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4348  AsnC family transcriptional regulator  99.36 
 
 
157 aa  318  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281114  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4019  AsnC family transcriptional regulator  99.36 
 
 
157 aa  318  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814285  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4270  AsnC family transcriptional regulator  96.79 
 
 
157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.34453  normal  0.84826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1672  AsnC family transcriptional regulator  96.18 
 
 
157 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.483706 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0800  putative leucine-responsive regulatory protein  90.97 
 
 
164 aa  288  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338493  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1107  AsnC family transcriptional regulator  90.97 
 
 
164 aa  288  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1764  putative leucine-responsive regulatory protein  90.97 
 
 
164 aa  288  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1595  bkd operon transcriptional regulator  90.97 
 
 
155 aa  287  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0665  putative leucine-responsive regulatory protein  90.97 
 
 
155 aa  287  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2393  AsnC family transcriptional regulator  90.97 
 
 
155 aa  287  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1184  bkd operon transcriptional regulator  90.97 
 
 
155 aa  287  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  82.05 
 
 
157 aa  259  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  78.81 
 
 
157 aa  244  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  66.45 
 
 
158 aa  215  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 
156 aa  137  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 
175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  44.94 
 
 
161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  40.38 
 
 
158 aa  127  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
175 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 
163 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  39.33 
 
 
161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 
152 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  38.46 
 
 
229 aa  124  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  40.65 
 
 
162 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  40.65 
 
 
162 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  42 
 
 
152 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  38.46 
 
 
175 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
161 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  38.46 
 
 
175 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
161 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  38.46 
 
 
175 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
161 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  38.46 
 
 
175 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
161 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
161 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
161 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
161 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 
152 aa  123  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
175 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  38.46 
 
 
229 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1074  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
157 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.405104  hitchhiker  0.000029673 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
202 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
202 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 
159 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  40.65 
 
 
162 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 
161 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
162 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
161 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
163 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  43.42 
 
 
158 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 
161 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 
177 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  41.03 
 
 
164 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  41.03 
 
 
164 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  41.03 
 
 
164 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  122  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  122  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  121  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 
164 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  122  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  122  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  121  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  121  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  121  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  40.65 
 
 
166 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  42.11 
 
 
173 aa  121  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  121  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
163 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
163 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  121  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
163 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
163 aa  120  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 
163 aa  120  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  41.94 
 
 
167 aa  120  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
181 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>