More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4337 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 166 aa  341  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  98.19 
 
 		 166 aa  337  5e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  98.19 
 
 		 166 aa  337  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  98.19 
 
 		 166 aa  337  5e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  97.59 
 
 		 166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  72.37 
 
 		 162 aa  229  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  69.74 
 
 		 159 aa  229  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 161 aa  221  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  63.87 
 
 		 166 aa  207  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 165 aa  166  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  51.97 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 169 aa  158  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 158 aa  158  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  51.32 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  51.61 
 
 		 159 aa  157  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 157 aa  157  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 158 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 158 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 158 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 158 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  49.68 
 
 		 163 aa  153  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  49.68 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  50.99 
 
 		 155 aa  152  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  48.12 
 
 		 172 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 159 aa  150  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  49.03 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  49.03 
 
 		 159 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  46.5 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  46.5 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  46.5 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  46.1 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  45.45 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03286  transcriptional regulator AsnC family  45.91 
 
 		 189 aa  131  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  43.23 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  42.11 
 
 		 229 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  42.11 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  42.11 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  42.11 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  41.03 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  42.11 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  42.11 
 
 		 229 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 202 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 175 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 160 aa  124  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  43.56 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  43.23 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1595  bkd operon transcriptional regulator  44.37 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0800  putative leucine-responsive regulatory protein  44.37 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338493  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1764  putative leucine-responsive regulatory protein  44.37 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 175 aa  121  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1107  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0665  putative leucine-responsive regulatory protein  44.37 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377599  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2393  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1184  bkd operon transcriptional regulator  44.37 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  42.11 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  43.42 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 222 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>