More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1192 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  329  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  48.34 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 181 aa  140  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 154 aa  140  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  44.03 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  43.87 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  43.87 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  42.11 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  42.11 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  42.11 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  42.11 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  40.79 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 163 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  42.59 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 166 aa  133  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  42.38 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 157 aa  131  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 188 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  51.08 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  44.83 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  39.52 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  39.52 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  40 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  40 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  40 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  40 
 
 		 222 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  41.45 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  40 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 213 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 163 aa  127  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 175 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  43.51 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  39.87 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 153 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  44.16 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 174 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 162 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  41.06 
 
 		 229 aa  124  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  43.59 
 
 		 169 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 161 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  41.06 
 
 		 229 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 152 aa  123  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  41.06 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 202 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  41.06 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  43.51 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 202 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>