More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1429 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  326  9e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  74 
 
 
153 aa  235  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  71.33 
 
 
153 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  71.33 
 
 
153 aa  231  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  70.67 
 
 
153 aa  229  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 
158 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  49.04 
 
 
159 aa  157  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 
172 aa  155  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
160 aa  154  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  51.7 
 
 
174 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 
152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  46.71 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 
157 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
153 aa  141  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  49.65 
 
 
145 aa  141  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
153 aa  140  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 
149 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  48.63 
 
 
155 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  48.25 
 
 
155 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  44.08 
 
 
169 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  45.45 
 
 
153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  47.18 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  45.83 
 
 
181 aa  130  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 
152 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  44.29 
 
 
164 aa  130  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  44.14 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  48.3 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
156 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  48.28 
 
 
149 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
158 aa  127  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 
177 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
154 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
152 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
152 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
152 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  45.07 
 
 
154 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  41.78 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 
157 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
152 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 
150 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 
150 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
150 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 
161 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  40.97 
 
 
152 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
161 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
150 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3619  transcriptional regulator, AsnC family  40.54 
 
 
174 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.378157  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  42 
 
 
229 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0270  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 
153 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  45.14 
 
 
153 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
153 aa  121  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
154 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 
154 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  41.33 
 
 
175 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  41.33 
 
 
175 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  41.33 
 
 
175 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  41.33 
 
 
175 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 
175 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
202 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
154 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  41.33 
 
 
229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
154 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
154 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
156 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
154 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
157 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
175 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5854  transcriptional regulator AsnC family  39.19 
 
 
154 aa  118  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
154 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
202 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
154 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 
164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 
174 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 
162 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 
174 aa  117  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
157 aa  117  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 
153 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
174 aa  117  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 
213 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 
157 aa  117  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  42.18 
 
 
153 aa  116  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>