More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1095 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
150 aa  297  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  94.48 
 
 
149 aa  254  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  75.17 
 
 
149 aa  214  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  65.97 
 
 
155 aa  193  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  65.28 
 
 
155 aa  191  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  62.24 
 
 
153 aa  189  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  61.54 
 
 
154 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  61.54 
 
 
154 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6081  transcriptional regulator  57.86 
 
 
144 aa  173  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  61.76 
 
 
145 aa  168  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  53.1 
 
 
174 aa  154  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0864  putative alanine catabolic operon transcriptional regulator  66.97 
 
 
132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  56.43 
 
 
150 aa  152  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  48.97 
 
 
158 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  51.39 
 
 
153 aa  147  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  50.69 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 
153 aa  144  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
152 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  48.61 
 
 
153 aa  143  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  48.61 
 
 
153 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 
153 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  51.02 
 
 
159 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  51.06 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  50.69 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  52.08 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
157 aa  137  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  46.53 
 
 
153 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  46.81 
 
 
160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  48.61 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  47.52 
 
 
169 aa  130  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  48.61 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1173  AsnC family transcriptional regulator  48.61 
 
 
159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  45.83 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  49.31 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  48.94 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  45.83 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 
181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  46.21 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 
156 aa  124  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 
152 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
176 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
156 aa  123  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  46.26 
 
 
172 aa  123  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 
177 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  47.76 
 
 
147 aa  122  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  46.1 
 
 
155 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 
163 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  43.45 
 
 
153 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  43.36 
 
 
155 aa  121  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  48.23 
 
 
153 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  48.23 
 
 
153 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  44.68 
 
 
155 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3082  transcriptional regulator, AsnC family  47.59 
 
 
166 aa  120  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 
157 aa  120  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  42.76 
 
 
153 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 
162 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  47.01 
 
 
172 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  47.52 
 
 
153 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2062  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
172 aa  118  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300551  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 
157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  45.39 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  44.6 
 
 
213 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0723  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 
154 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
165 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  46.27 
 
 
167 aa  117  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  41.84 
 
 
152 aa  115  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  44.78 
 
 
154 aa  115  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0773  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  46.51 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  45.83 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  46.51 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  42.96 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  40.28 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  46.51 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  46.51 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  46.51 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  43.26 
 
 
164 aa  114  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  43.26 
 
 
164 aa  114  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  43.26 
 
 
164 aa  114  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  43.26 
 
 
164 aa  114  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  46.51 
 
 
164 aa  114  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 
202 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2774  AsnC family transcriptional regulator  47.1 
 
 
150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.315931  normal  0.712036 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  42.55 
 
 
164 aa  114  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  41.73 
 
 
156 aa  114  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  42.55 
 
 
164 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>