More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1609 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  96.73 
 
 
153 aa  303  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  88.89 
 
 
153 aa  283  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  81.05 
 
 
153 aa  266  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  71.33 
 
 
157 aa  232  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
172 aa  151  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  53.1 
 
 
174 aa  149  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 
159 aa  147  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  51.72 
 
 
145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 
158 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 
153 aa  141  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 
160 aa  140  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  47.92 
 
 
152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  47.92 
 
 
152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  47.22 
 
 
152 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  49.32 
 
 
155 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  47.95 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  49.32 
 
 
155 aa  134  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  47.26 
 
 
154 aa  133  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  48.59 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  45.39 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  44.52 
 
 
153 aa  130  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  44.83 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  45.77 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  45.03 
 
 
155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
154 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
155 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  46.58 
 
 
149 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
154 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 
153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 
157 aa  124  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  47.89 
 
 
155 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
154 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
181 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  46.53 
 
 
150 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
154 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 
156 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 
153 aa  121  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  41.56 
 
 
161 aa  120  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
156 aa  120  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2062  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 
172 aa  118  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300551  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 
162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 
162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  42.96 
 
 
229 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  43.17 
 
 
213 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 
157 aa  117  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  43.33 
 
 
162 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  42.25 
 
 
175 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  42.25 
 
 
175 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  42.25 
 
 
175 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  42.25 
 
 
175 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
161 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
202 aa  116  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
177 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 
164 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 
175 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  42.07 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  42.96 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  42.25 
 
 
229 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6081  transcriptional regulator  43.18 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
202 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
152 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
157 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
159 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 
156 aa  114  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 
154 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  40.56 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 
150 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 
158 aa  114  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>