More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0557 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  308  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  46 
 
 		 169 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 157 aa  133  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  45.14 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.33 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  47.89 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  40.26 
 
 		 229 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  47.89 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  39.61 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  39.61 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  39.61 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 202 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  39.61 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  39.61 
 
 		 229 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  41.72 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 202 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 172 aa  121  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 152 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 175 aa  120  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  42.36 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 181 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 164 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  43.66 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545436 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  39.6 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  39.61 
 
 		 161 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 161 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 161 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 175 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  43.66 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  38 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2062  AsnC family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6081  transcriptional regulator  43.51 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  36.6 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  37.33 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  37.33 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  37.33 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  40.67 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 162 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  41.55 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>