More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1393 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0409  AsnC family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0682  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 155 aa  121  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  41.22 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 176 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  42.45 
 
 		 161 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  45.07 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 152 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 151 aa  113  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.86 
 
 		 162 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  39.86 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.82 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  40.41 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  41.22 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 167 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  39.86 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  39.19 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  39.19 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  39.19 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 150 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 174 aa  110  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0110  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.655072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  42.76 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 151 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 196 aa  110  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  39.16 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  37.01 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.85 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  37.01 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 181 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  40 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2969  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>