More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0427 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
150 aa  297  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  77.33 
 
 
150 aa  233  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  72.67 
 
 
151 aa  220  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  69.54 
 
 
153 aa  214  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  70.47 
 
 
150 aa  214  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  67.33 
 
 
150 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  67.33 
 
 
150 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 
150 aa  208  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  66 
 
 
150 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  69.8 
 
 
150 aa  204  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  60 
 
 
151 aa  187  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  60.67 
 
 
151 aa  186  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  48 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3924  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
150 aa  121  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
160 aa  120  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
158 aa  120  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.545436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7861  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.96 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0789573  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2383  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000319505  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
196 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
153 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  117  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 
155 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0071  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 
155 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  43.92 
 
 
159 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.67 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
158 aa  114  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 
161 aa  114  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
153 aa  114  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 
172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 
167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3254  transcriptional regulator, AsnC family  46.09 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
162 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 
157 aa  114  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
159 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3658  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 
154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  42.17 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  41.33 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0580  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015391  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 
154 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 
157 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
174 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
159 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
181 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  40.72 
 
 
171 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 
154 aa  111  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  40.72 
 
 
174 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  41.51 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 
174 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 
174 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0270  AsnC family transcriptional regulator  44.3 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 
174 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
154 aa  110  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3082  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 
166 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
157 aa  110  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
177 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  41.82 
 
 
218 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
166 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
166 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
166 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  40.12 
 
 
174 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
159 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  43.15 
 
 
175 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  43.15 
 
 
175 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  40.12 
 
 
168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  40.12 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  40.12 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  40.12 
 
 
222 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>