More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0682 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0682  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  340  5.999999999999999e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0409  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 196 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 150 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  38.46 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.93 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  38.26 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 154 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 154 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 154 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  36.25 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  36.25 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  36.25 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  36.25 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  36.25 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  36.25 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  36.25 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  36.25 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  36.25 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  36.25 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  36.25 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  36.25 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  36.25 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  36.25 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  36.25 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  36.25 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  35.62 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  35.62 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  35.62 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  37.33 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  35.62 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  37.11 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  37.11 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  37.11 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 162 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 156 aa  101  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 154 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 154 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  35.85 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  36.05 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  35 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  36.05 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2062  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 172 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  39.44 
 
 		 151 aa  99.8  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  35 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  35.81 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 181 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0927  leucine-responsive regulatory DNA-binding transcription regulator protein  36.36 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 156 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 150 aa  98.2  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  36.3 
 
 		 162 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 162 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 162 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 157 aa  97.8  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  34.38 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.81 
 
 		 162 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.14 
 
 		 156 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 160 aa  97.4  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 152 aa  97.4  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 158 aa  97.4  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 195 aa  97.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 169 aa  97.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 167 aa  97.4  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>