More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1501 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  323  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 172 aa  164  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 157 aa  157  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 152 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 152 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  45.58 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  47.18 
 
 		 153 aa  144  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  44.9 
 
 		 153 aa  143  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  47.89 
 
 		 154 aa  143  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  47.18 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  48.97 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  45.64 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  43.42 
 
 		 161 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6081  transcriptional regulator  45.59 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 150 aa  131  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  42.76 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 181 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  43.92 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  41.13 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  40.54 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 213 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  38.93 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 162 aa  124  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  41.72 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  41.72 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  41.83 
 
 		 175 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  41.83 
 
 		 175 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 		 175 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  41.83 
 
 		 175 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  41.83 
 
 		 175 aa  120  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 202 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  41.83 
 
 		 229 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  40.38 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0181  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.54 
 
 		 150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  41.18 
 
 		 229 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 156 aa  117  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 175 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  43.45 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  41.96 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>