More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0806 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  303  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  59.48 
 
 		 155 aa  176  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  58.28 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 155 aa  173  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4775  transcriptional regulator, AsnC family  58.78 
 
 		 154 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339738  normal  0.145309 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4829  transcriptional regulator, AsnC family  57.82 
 
 		 154 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69587  normal  0.0580849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6081  transcriptional regulator  54.23 
 
 		 144 aa  161  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0864  putative alanine catabolic operon transcriptional regulator  52.78 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0261477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  50.34 
 
 		 145 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  56.43 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  46.53 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 153 aa  123  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 174 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 157 aa  110  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 176 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  40 
 
 		 169 aa  110  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44.68 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  42.36 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 213 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 		 175 aa  107  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  41.26 
 
 		 161 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 161 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 153 aa  106  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  42.25 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  42.25 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  42.25 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  41.26 
 
 		 229 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  42.25 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  42.25 
 
 		 229 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 202 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 181 aa  103  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1897  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.129627 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  38.78 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 175 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  39.29 
 
 		 155 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 157 aa  99.4  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4300  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4066  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3217  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7223  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1713  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4306  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269184 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4195  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 169 aa  98.2  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 154 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3718  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 160 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3829  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>