More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6436 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  310  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  67.32 
 
 		 153 aa  207  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  66.01 
 
 		 153 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1173  AsnC family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3082  transcriptional regulator, AsnC family  51.66 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  52 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  48.63 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  46.26 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  46.26 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  47.62 
 
 		 175 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  47.62 
 
 		 175 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  47.62 
 
 		 175 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  47.62 
 
 		 175 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 202 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  47.62 
 
 		 229 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 202 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  45.07 
 
 		 175 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 181 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  44.81 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  46.94 
 
 		 229 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  125  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.45 
 
 		 153 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  43.92 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  45.33 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 213 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  44.16 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  45.45 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  45.33 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  44.76 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  43.36 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  43.36 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  43.36 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  43.36 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  43.36 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  43.36 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  43.36 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  43.36 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  44.06 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  43.36 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  44.06 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  43.36 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  43.36 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  43.36 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  43.36 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  43.36 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  44.06 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  44.06 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  43.36 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  44.06 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>