More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2995 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  100 
 
 		 153 aa  310  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  98.69 
 
 		 153 aa  309  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  67.32 
 
 		 154 aa  207  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1173  AsnC family transcriptional regulator  62 
 
 		 159 aa  179  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3082  transcriptional regulator, AsnC family  53.02 
 
 		 166 aa  166  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 175 aa  137  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 156 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  46.67 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  48 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  48 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  48 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  48 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  48 
 
 		 229 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  48 
 
 		 229 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 202 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 175 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 181 aa  132  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  45.7 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 156 aa  130  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  45.75 
 
 		 161 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 161 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  45.1 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  45.45 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  43.51 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 174 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 213 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 161 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 157 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  44.76 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  42.86 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 172 aa  124  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  44.37 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  42.38 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 155 aa  123  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  40.56 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  43.33 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  44.52 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.21 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  41.96 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 170 aa  120  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>