More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0021 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
152 aa  307  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  56.67 
 
 
154 aa  184  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  55.92 
 
 
153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 
153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  45.27 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  44.74 
 
 
153 aa  141  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
158 aa  140  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  41.33 
 
 
155 aa  137  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  40.79 
 
 
157 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
152 aa  135  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  41.33 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  44.08 
 
 
172 aa  133  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  42.18 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
156 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  42.95 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  40 
 
 
156 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
159 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  42.67 
 
 
153 aa  130  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
153 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  42 
 
 
175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  42 
 
 
175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  42 
 
 
175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  42 
 
 
175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
153 aa  127  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
159 aa  127  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  42 
 
 
229 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 
152 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
202 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
157 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
175 aa  124  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
180 aa  124  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
156 aa  125  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  41.33 
 
 
229 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.33 
 
 
153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
175 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
152 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
156 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
156 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
156 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
157 aa  124  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
156 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
155 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
163 aa  124  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
196 aa  123  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
162 aa  124  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  40.13 
 
 
157 aa  123  8.000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
163 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
155 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
155 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 
155 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.67 
 
 
155 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  39.33 
 
 
162 aa  122  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
166 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
157 aa  122  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
153 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
165 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 
150 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
156 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  36.67 
 
 
153 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2595  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
162 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  36.67 
 
 
153 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
159 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
154 aa  122  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
162 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
164 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
159 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  41.72 
 
 
159 aa  121  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
181 aa  120  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>