More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3082 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3082  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 166 aa  337  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1173  AsnC family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 159 aa  189  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  53.02 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  51.68 
 
 		 153 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 154 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  47.65 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 181 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 174 aa  121  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  42.07 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 156 aa  118  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4823  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal  0.0730617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  41.77 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  41.1 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  41.1 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 152 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.36 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 153 aa  111  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 150 aa  110  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 155 aa  111  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  41.84 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2123  AsnC family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0513877  decreased coverage  0.00440064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0899  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00194159  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0354  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0723872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0896  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0486332  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1056  transcription regulator AsnC  38.71 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0654  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0956459  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2489  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383642  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0102  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6022  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5778  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 156 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  37.41 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  37.41 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  37.41 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  37.41 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1095  transcriptional regulator, AsnC family  47.59 
 
 		 150 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00486405  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 		 151 aa  107  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  39.46 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  40.67 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  39.38 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  39.38 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  37.41 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  37.41 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  37.41 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  37.41 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  39.38 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  39.38 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  41.6 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0712  AsnC family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369327  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>