More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2400 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2400  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3838  AsnC family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 154 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277809  normal  0.961023 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3584  AsnC family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3944  AsnC family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4423  AsnC family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 154 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2142  AsnC family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 154 aa  185  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.390853  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4638  AsnC family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 154 aa  184  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3321  AsnC family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1730  AsnC family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 161 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 162 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 182 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 182 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 182 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  43.2 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  41.38 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  43.2 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.14 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03072  leucine responsive regulatory protein  43.62 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  36.3 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  42.14 
 
 		 162 aa  101  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  42.06 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  44.26 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  42.06 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  42.06 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  42.06 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3163  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 162 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  42.54 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  40 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  41.46 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.46 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  40 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  41.27 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  41.27 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  41.27 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  41.27 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  41.73 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  40 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0927  leucine-responsive regulatory DNA-binding transcription regulator protein  40.8 
 
 		 165 aa  94.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  42.52 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  39.68 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  42.52 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  34.23 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  42.52 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 167 aa  90.1  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 156 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1890  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06912  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  34.11 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4392  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  41.73 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  41.73 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  36.72 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 152 aa  88.6  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  41.73 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  88.6  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 153 aa  88.6  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  41.73 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>