More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4423 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3944  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3584  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61907  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4423  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2142  AsnC family transcriptional regulator  98.7 
 
 
154 aa  308  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.390853  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3838  AsnC family transcriptional regulator  98.05 
 
 
154 aa  306  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277809  normal  0.961023 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3321  AsnC family transcriptional regulator  98.05 
 
 
154 aa  305  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4638  AsnC family transcriptional regulator  95.45 
 
 
154 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566675  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2400  AsnC family transcriptional regulator  59.33 
 
 
151 aa  186  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1730  AsnC family transcriptional regulator  45.21 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.296944  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2730  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256051  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000635  transcriptional regulator AsnC family  36.73 
 
 
159 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5501  transcriptional regulator, AsnC family  40.62 
 
 
165 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105983 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  39.84 
 
 
165 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2918  transcriptional regulator, AsnC family  39.67 
 
 
158 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  39.84 
 
 
165 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  42.19 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2693  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  42.19 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3702  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
217 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5002  transcriptional regulator, AsnC family  38.02 
 
 
158 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947016  normal  0.33214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  42.45 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0261  transcriptional regulator, AsnC family  38.02 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0144  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.02 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  42.45 
 
 
162 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5887  transcriptional regulator AsnC family  38.84 
 
 
158 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0783  AsnC family transcriptional regulator  38.17 
 
 
167 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  39.23 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  41.27 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  39.23 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4412  transcriptional regulator, AsnC family  38.02 
 
 
158 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  39.23 
 
 
152 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  40.32 
 
 
158 aa  94  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  43.7 
 
 
161 aa  93.6  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  42.34 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  42.34 
 
 
162 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  40.31 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.34 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  41.73 
 
 
162 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  40.62 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  41.73 
 
 
162 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  39.69 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  40.83 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3163  AsnC family transcriptional regulator  38.28 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  37.3 
 
 
153 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1926  AsnC family transcriptional regulator  37.19 
 
 
194 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883962  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 
159 aa  90.9  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  36.22 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5590  AsnC family transcriptional regulator  38.02 
 
 
158 aa  91.3  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0059  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 
163 aa  91.3  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256437  hitchhiker  0.00608597 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  42.74 
 
 
165 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  37.19 
 
 
153 aa  89.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5628  transcriptional regulator, AsnC family  36.22 
 
 
164 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  36.51 
 
 
153 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  39.06 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  41.88 
 
 
154 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1584  transcriptional regulator, AsnC family  35.82 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0051  AsnC family transcriptional regulator  36.15 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2147  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
158 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  37.98 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  35.54 
 
 
158 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
165 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6283  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.9563  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6686  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 
169 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.839318  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6347  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
177 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
152 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
182 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
174 aa  88.6  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
182 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
157 aa  88.2  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3860  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  39.2 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
182 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
182 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
152 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6451  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
152 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6050  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426837  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  37.98 
 
 
162 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
154 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
163 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
162 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  36.51 
 
 
157 aa  87.8  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
182 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
162 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
166 aa  87.8  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  39.67 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0927  leucine-responsive regulatory DNA-binding transcription regulator protein  39.84 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  40.16 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
152 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6096  transcriptional regulator, AsnC family  37.3 
 
 
165 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69834  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  38.76 
 
 
162 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  34.35 
 
 
158 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>