More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0328 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3924  AsnC family transcriptional regulator  67.33 
 
 		 150 aa  214  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  57.62 
 
 		 154 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3558  AsnC family transcriptional regulator  58 
 
 		 153 aa  189  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 152 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  42 
 
 		 160 aa  126  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1361  AsnC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  42.67 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 152 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 150 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2180  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.642744  normal  0.728347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2933  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256284  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 		 172 aa  117  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  116  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  116  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  36.77 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  36.77 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  38.56 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  36.77 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  39.33 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3163  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  34.67 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  38 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2948  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780981 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  34.67 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6436  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 154 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.527241  normal  0.285148 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 153 aa  113  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>