More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3924 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3924  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  306  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3558  AsnC family transcriptional regulator  67.33 
 
 		 153 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  67.33 
 
 		 156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 154 aa  199  9e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  38.97 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3737  transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.33 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46460  Transcriptional regulator, AsnC-fanily  38.67 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 150 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  35.33 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 158 aa  113  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  35.22 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3355  putative transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417846  normal  0.0189646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 218 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3989  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3768  transcriptional regulator, AsnC family  39.6 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  35.33 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3421  AsnC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2784  AsnC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  36.67 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  32.12 
 
 		 171 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  32.12 
 
 		 168 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 171 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  32.12 
 
 		 171 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  32.12 
 
 		 171 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 171 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 169 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4957  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272407  normal  0.193763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>