More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4405 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  44.76 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  45.21 
 
 		 172 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  43.45 
 
 		 167 aa  131  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 152 aa  130  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3139  regulatory protein AsnC/Lrp family  41.91 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.91917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.51 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.67 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4193  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.209273  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  38.78 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  36.49 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  35.1 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  35.1 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  35.1 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  35.1 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  35.1 
 
 		 229 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  33.78 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 165 aa  110  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  34.44 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  34.44 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  34.44 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  34.44 
 
 		 229 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.09 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 175 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0850  glutamate uptake regulatory protein Grp  34.46 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  33.77 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0703  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0327834  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 213 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2821  regulatory protein AsnC/Lrp family  36.36 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  34.21 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  34.44 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  36.3 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  32.68 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>