More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6651 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6651  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 171 aa  338  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3070  AsnC family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 158 aa  174  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  50.66 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  50.66 
 
 		 157 aa  154  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  50.97 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  50.97 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  47.74 
 
 		 161 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  48.39 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4939  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  48.34 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  48.34 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  47.33 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 158 aa  134  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  45.81 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  45.81 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4648  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0841161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  48.03 
 
 		 159 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  48.03 
 
 		 169 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  43.71 
 
 		 155 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  40.38 
 
 		 229 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  40.38 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  40.38 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  40.38 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  40.38 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  40.38 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 202 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  48.03 
 
 		 159 aa  124  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  41.88 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 174 aa  121  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 155 aa  121  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 162 aa  120  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  35.67 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  43.42 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 162 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 153 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  41.18 
 
 		 161 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3542  transcriptional regulator, AsnC family  37.01 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000609578  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  42.76 
 
 		 157 aa  118  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>