More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0913 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  100 
 
 
361 aa  733    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  42.9 
 
 
368 aa  261  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.11 
 
 
387 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.17 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 
349 aa  149  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  30.47 
 
 
363 aa  146  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  28.61 
 
 
404 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.67 
 
 
346 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  30 
 
 
349 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 
377 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  29.95 
 
 
410 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.28 
 
 
496 aa  144  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  29.01 
 
 
390 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 
405 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 
399 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 
358 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 
399 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 
363 aa  136  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 
359 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  26.67 
 
 
561 aa  135  8e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  28.53 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.16 
 
 
397 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 
384 aa  134  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 
330 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 
414 aa  133  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.73 
 
 
373 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.86 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  27.46 
 
 
399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  28.45 
 
 
479 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
406 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 
330 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  28.53 
 
 
332 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
406 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 
391 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  26.38 
 
 
387 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  26.59 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  25.21 
 
 
356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 
418 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 
405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 
389 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 
399 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  24.36 
 
 
354 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 
394 aa  126  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 
380 aa  126  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 
393 aa  126  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  26.89 
 
 
397 aa  126  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 
330 aa  126  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  27.27 
 
 
335 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 
364 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 
377 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  29.51 
 
 
501 aa  125  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 
378 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 
356 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.83 
 
 
327 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  30 
 
 
769 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 
393 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  25.36 
 
 
366 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  28.95 
 
 
332 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  27.25 
 
 
355 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 
393 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.71 
 
 
394 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 
325 aa  123  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.96 
 
 
334 aa  123  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 
372 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 
333 aa  123  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 
358 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  23.66 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 
358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 
358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  25 
 
 
407 aa  119  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 
396 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 
565 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 
480 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 
428 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  26.89 
 
 
373 aa  117  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 
381 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 
347 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 
397 aa  116  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  28.06 
 
 
417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 
391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  25.98 
 
 
422 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  27 
 
 
359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  24.36 
 
 
394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  27.02 
 
 
383 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 
390 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 
380 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 
358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 
357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.09 
 
 
380 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>