More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3206 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
412 aa  839    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  71.64 
 
 
396 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  69.65 
 
 
405 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  70.68 
 
 
410 aa  570  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  71.21 
 
 
396 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  71.21 
 
 
395 aa  565  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  70.2 
 
 
391 aa  555  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  69.63 
 
 
429 aa  557  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  70.45 
 
 
401 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  70.45 
 
 
401 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  68.07 
 
 
409 aa  556  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  70.45 
 
 
401 aa  556  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  59.88 
 
 
367 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  41.39 
 
 
337 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  39.51 
 
 
347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  46.79 
 
 
319 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  31.59 
 
 
479 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  33.23 
 
 
429 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.85 
 
 
496 aa  150  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  34.01 
 
 
398 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 
399 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  34.62 
 
 
391 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  31.23 
 
 
332 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  31.38 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  29.6 
 
 
389 aa  137  4e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 
327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 
378 aa  136  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.83 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  31.27 
 
 
333 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 
380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  30.57 
 
 
565 aa  133  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0609  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 
384 aa  131  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 
316 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 
317 aa  129  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.98 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  28.13 
 
 
501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 
480 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 
389 aa  127  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 
330 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  32.06 
 
 
491 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 
384 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  33.23 
 
 
373 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  29.49 
 
 
561 aa  123  7e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 
418 aa  122  9e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  29.51 
 
 
372 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.7 
 
 
349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 
363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.47 
 
 
397 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  28.37 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  29.59 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  32.29 
 
 
491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  30.83 
 
 
487 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 
491 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 
491 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 
491 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  32.01 
 
 
491 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 
491 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 
491 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 
358 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 
358 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 
482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  31.23 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  32.05 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  27.87 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  29.22 
 
 
769 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 
330 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  27.94 
 
 
359 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 
357 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  27.87 
 
 
378 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  27.87 
 
 
377 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 
395 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  28.53 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  31.16 
 
 
491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.81 
 
 
399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  27.6 
 
 
377 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  29.51 
 
 
390 aa  111  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 
405 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  29.02 
 
 
453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  31.79 
 
 
394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 
358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  30.73 
 
 
422 aa  110  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
356 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30.03 
 
 
397 aa  110  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  31.78 
 
 
415 aa  108  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 
356 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  29.53 
 
 
375 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 
323 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 
323 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  27.93 
 
 
333 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>