More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3864 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 319 aa  651    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  45.34 
 
 		 347 aa  272  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  47.48 
 
 		 367 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  42.41 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  45.1 
 
 		 391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  45.1 
 
 		 401 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  45.1 
 
 		 401 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  45.1 
 
 		 401 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  46.4 
 
 		 410 aa  232  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  44.29 
 
 		 405 aa  232  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  44.06 
 
 		 396 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  46.79 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  45.68 
 
 		 396 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  44.8 
 
 		 395 aa  225  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  45.26 
 
 		 429 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  42.21 
 
 		 409 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  32.22 
 
 		 398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  35.23 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.9 
 
 		 349 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  30.39 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  29.7 
 
 		 346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  29.75 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  28.16 
 
 		 479 aa  123  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 496 aa  122  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  29.72 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  31.23 
 
 		 347 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  28.87 
 
 		 414 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  28.87 
 
 		 510 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 501 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.67 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  28.92 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28 
 
 		 565 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 325 aa  113  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 		 407 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  29.13 
 
 		 382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  30.03 
 
 		 391 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  34.81 
 
 		 423 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  28.16 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  34.81 
 
 		 423 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  27.59 
 
 		 359 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  29.39 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 		 358 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 453 aa  112  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  27.92 
 
 		 410 aa  112  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  28.07 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  31.81 
 
 		 409 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 		 389 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 380 aa  109  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  26.8 
 
 		 356 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  27.46 
 
 		 366 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 378 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 359 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  32.04 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  29.13 
 
 		 418 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  34.91 
 
 		 491 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  28.33 
 
 		 561 aa  106  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  27.63 
 
 		 377 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  33.54 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 406 aa  105  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 380 aa  105  9e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  29.51 
 
 		 335 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  30.49 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  28.66 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  29.19 
 
 		 769 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.48 
 
 		 399 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  25.66 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  31.95 
 
 		 487 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  34.36 
 
 		 390 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 418 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  28.47 
 
 		 482 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  29.81 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  29 
 
 		 399 aa  102  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  28.47 
 
 		 422 aa  102  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 		 407 aa  102  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.27 
 
 		 397 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  28.3 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 		 491 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>