More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2664 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  100 
 
 
383 aa  791    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  40.18 
 
 
347 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  38.86 
 
 
360 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  35.31 
 
 
491 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  35.31 
 
 
491 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  35.31 
 
 
491 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  35.31 
 
 
491 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  35.31 
 
 
491 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  35.31 
 
 
491 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  35.31 
 
 
491 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  35.01 
 
 
491 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  34.82 
 
 
491 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  34.82 
 
 
482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  33.13 
 
 
487 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  32.35 
 
 
423 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  32.35 
 
 
423 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  33.04 
 
 
418 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  33.33 
 
 
510 aa  169  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2953  Radical SAM domain protein  32.05 
 
 
439 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  29.79 
 
 
420 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  32.75 
 
 
389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  33.04 
 
 
377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  32.66 
 
 
380 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 
380 aa  142  8e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  29.94 
 
 
349 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.12 
 
 
346 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 
378 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  29.94 
 
 
561 aa  133  6e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 
384 aa  132  7.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 
429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  30.51 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 
480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  30.9 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 
377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  27.79 
 
 
334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 
496 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 
501 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  27.67 
 
 
397 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 
391 aa  124  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 
333 aa  123  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  30.03 
 
 
335 aa  123  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 
358 aa  122  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  29.08 
 
 
349 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 
428 aa  120  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17970  predicted Fe-S oxidoreductase  30.82 
 
 
356 aa  119  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  28.2 
 
 
356 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 
354 aa  119  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 
327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 
405 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.93 
 
 
479 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  29.83 
 
 
356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.71 
 
 
330 aa  117  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.9 
 
 
391 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.89 
 
 
397 aa  116  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  27.02 
 
 
361 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  28.96 
 
 
333 aa  116  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.25 
 
 
363 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  30.31 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  26.38 
 
 
373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  29.41 
 
 
769 aa  115  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  29.06 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  30.03 
 
 
373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  30.6 
 
 
367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.65 
 
 
390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 
323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 
372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 
356 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  28.1 
 
 
363 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 
347 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 
390 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 
359 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.81 
 
 
399 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
418 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  30.18 
 
 
381 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  29.12 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  25.87 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  25.22 
 
 
337 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 
393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  25.58 
 
 
358 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  28.27 
 
 
332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  27.53 
 
 
401 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  29.71 
 
 
365 aa  110  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 
401 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 
316 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 
401 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 
380 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 
330 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  27.89 
 
 
332 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 
323 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  31.71 
 
 
387 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  28.37 
 
 
375 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 
404 aa  106  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  25.82 
 
 
422 aa  105  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  26.54 
 
 
378 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>