More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0587 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  100 
 
 		 376 aa  766    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  57.22 
 
 		 367 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  32.77 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  30.67 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 369 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  35.81 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 491 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  27.86 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  29.97 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.21 
 
 		 346 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  30.46 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  32.09 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  30.52 
 
 		 399 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  29.05 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  29.85 
 
 		 491 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1969  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.66 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.046264  normal  0.222604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3305  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.32 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  35.47 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  35 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38780  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.87 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  29.32 
 
 		 487 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.19 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  29.33 
 
 		 479 aa  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  29.8 
 
 		 406 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  31.06 
 
 		 367 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  29.8 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.21 
 
 		 378 aa  102  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  29.5 
 
 		 491 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41640  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.99 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  28.25 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  28.77 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 358 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  32.46 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 358 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  30.16 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  27.78 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 482 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  26.87 
 
 		 356 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 354 aa  96.7  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 429 aa  96.3  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 334 aa  96.3  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  24.22 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.73 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 446 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  30.48 
 
 		 356 aa  95.9  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  36.13 
 
 		 418 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  24.47 
 
 		 337 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  28.85 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 357 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.31 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.67 
 
 		 380 aa  94.7  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  26.26 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 333 aa  94  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0609  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  28.52 
 
 		 379 aa  93.2  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.56 
 
 		 397 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0573  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 		 363 aa  93.2  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119885  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 474 aa  93.2  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 411 aa  92.8  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.33 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0973479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  27.3 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.39 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4827  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.95 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.96 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 		 359 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.55 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.36 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  34.76 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  29.18 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4038  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.21 
 
 		 370 aa  90.5  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  29.47 
 
 		 396 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  23.41 
 
 		 561 aa  90.5  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  36.47 
 
 		 387 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 565 aa  90.1  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.33 
 
 		 380 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 		 496 aa  90.1  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  37.84 
 
 		 387 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 323 aa  90.1  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 		 359 aa  90.1  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 		 394 aa  90.1  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  28.43 
 
 		 405 aa  89.7  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  36.47 
 
 		 387 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>