257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0946 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 492 aa  1014    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 462 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  34.35 
 
 		 465 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  32.36 
 
 		 463 aa  252  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  38.5 
 
 		 453 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  31.83 
 
 		 489 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 		 476 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  31.88 
 
 		 461 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 		 460 aa  187  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  34.14 
 
 		 458 aa  187  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  33.6 
 
 		 456 aa  186  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  32.18 
 
 		 447 aa  186  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  29.36 
 
 		 450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  34.23 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 		 489 aa  177  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  28.85 
 
 		 450 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  29.08 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 447 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  32.2 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  29.89 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 		 485 aa  163  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  32.87 
 
 		 477 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  28.51 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 		 460 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  30.35 
 
 		 470 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  27.73 
 
 		 453 aa  149  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  28.61 
 
 		 476 aa  137  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  28.33 
 
 		 476 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  26.65 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 403 aa  123  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  23.58 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 		 436 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  23.43 
 
 		 486 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 		 467 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 		 434 aa  103  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 		 468 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 443 aa  99.8  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 518 aa  99.8  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  23.28 
 
 		 460 aa  90.5  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 447 aa  87.4  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 		 728 aa  84.3  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 507 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  26.3 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 442 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 442 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  25.23 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  25.23 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  30.05 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  31.13 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  26.05 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  24.54 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  30.24 
 
 		 298 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  26.18 
 
 		 398 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  24.86 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  25.57 
 
 		 473 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  24.03 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 481 aa  74.7  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.14 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.14 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.14 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  23.51 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  23.51 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  24.66 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  23.51 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.85 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24.12 
 
 		 453 aa  72  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  21.47 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.15 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  25.9 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>