285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1332 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1332  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 270 aa  556  1e-157  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  82.3 
 
 		 357 aa  435  1e-121  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  77.37 
 
 		 356 aa  418  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  74.49 
 
 		 380 aa  396  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  50.84 
 
 		 356 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0030  Radical SAM domain protein  47.76 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0572  radical SAM domain-containing protein  44.53 
 
 		 353 aa  225  7e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  48.54 
 
 		 356 aa  223  4e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  40.93 
 
 		 356 aa  215  7e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  32.28 
 
 		 372 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  34.87 
 
 		 380 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  34.24 
 
 		 383 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  32.44 
 
 		 367 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 		 372 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3828  radical SAM family protein  35.63 
 
 		 395 aa  99.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  31.15 
 
 		 489 aa  72.4  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  31.07 
 
 		 489 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  31.53 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 		 461 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 476 aa  62.4  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 447 aa  62.4  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  30.37 
 
 		 450 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  26.79 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  31.91 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  28.96 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  29.56 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  32.09 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  32.86 
 
 		 345 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  33.87 
 
 		 460 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 457 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 450 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  31.79 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  30.28 
 
 		 471 aa  57  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  30.87 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  32.88 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  23.2 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 453 aa  56.2  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 		 482 aa  55.8  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  29.69 
 
 		 422 aa  55.8  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  29.69 
 
 		 422 aa  55.8  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 		 482 aa  55.8  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  29.41 
 
 		 457 aa  55.8  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 		 481 aa  55.8  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 452 aa  55.5  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30.87 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  31.54 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 565 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  31.16 
 
 		 440 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1924  radical SAM superfamily protein  27.56 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  31.39 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  31.16 
 
 		 381 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 371 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  29.49 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  31.34 
 
 		 357 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 		 462 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 		 1005 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 		 442 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 450 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  30.28 
 
 		 446 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  33.83 
 
 		 462 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30.49 
 
 		 394 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 		 442 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 		 390 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  29.14 
 
 		 473 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 383 aa  53.5  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  27.9 
 
 		 368 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 467 aa  53.5  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  31.49 
 
 		 434 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  30.07 
 
 		 393 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  30.87 
 
 		 443 aa  52.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  26.56 
 
 		 383 aa  52.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  29.79 
 
 		 388 aa  52.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 365 aa  52.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  28.4 
 
 		 422 aa  52.4  0.000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 387 aa  52.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 1000 aa  52.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 1014 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  30.12 
 
 		 397 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  26.64 
 
 		 374 aa  51.6  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 		 476 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>