More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2370 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 462 aa  951    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  46.37 
 
 		 486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  38.08 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  39.78 
 
 		 464 aa  340  4e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  31.39 
 
 		 518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  30.09 
 
 		 464 aa  162  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  31.55 
 
 		 474 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 481 aa  150  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  26.34 
 
 		 484 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 		 450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  27.94 
 
 		 457 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  29.4 
 
 		 463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  27.77 
 
 		 450 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 465 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  25.9 
 
 		 450 aa  126  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 460 aa  122  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  23.09 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 462 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  25.06 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  22.64 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  23.63 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  33.89 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  26.05 
 
 		 453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 452 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  34.19 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  29.83 
 
 		 728 aa  108  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  24.17 
 
 		 489 aa  107  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  21.66 
 
 		 489 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 476 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  21.94 
 
 		 473 aa  103  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  34.93 
 
 		 476 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 		 476 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  33.56 
 
 		 476 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  25.8 
 
 		 351 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  22.71 
 
 		 452 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  25.91 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  27.15 
 
 		 434 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 		 486 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 		 436 aa  90.1  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 400 aa  90.1  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 440 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.61 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 460 aa  88.2  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 		 368 aa  87  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  33.96 
 
 		 484 aa  83.2  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  32.65 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  30.87 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  23.89 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  25 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  31.97 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  29.94 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  29.56 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  27.72 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  22.69 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  32.43 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0783  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  28.03 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  28.03 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  27.98 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  27.98 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  22.28 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  25.48 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7955  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 794 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.025578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>