More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1095 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 446 aa  927    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  54.4 
 
 		 471 aa  525  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  55.61 
 
 		 477 aa  513  1e-144  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  53.29 
 
 		 486 aa  506  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  48.65 
 
 		 451 aa  479  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  45.29 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  45.84 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  41.61 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  41.72 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  42.73 
 
 		 452 aa  364  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  39.96 
 
 		 462 aa  359  5e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  39.96 
 
 		 479 aa  358  7e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  39.82 
 
 		 466 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  37.62 
 
 		 460 aa  327  3e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  38.6 
 
 		 462 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  43.57 
 
 		 422 aa  318  9e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  43.57 
 
 		 422 aa  318  9e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  39.07 
 
 		 465 aa  316  7e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  37.3 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  37.21 
 
 		 482 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  38.86 
 
 		 460 aa  312  9e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  36.74 
 
 		 482 aa  310  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  36.22 
 
 		 460 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  39.68 
 
 		 481 aa  296  5e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  34.89 
 
 		 482 aa  286  7e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  32.55 
 
 		 482 aa  277  3e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  32.6 
 
 		 387 aa  212  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  36.33 
 
 		 362 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  32.69 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  32.69 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  26.49 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  30.69 
 
 		 325 aa  94.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.95 
 
 		 349 aa  90.1  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 		 330 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.15 
 
 		 479 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 418 aa  88.2  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.08 
 
 		 346 aa  87  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 		 349 aa  86.7  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.62 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 496 aa  83.2  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  25.98 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  24.53 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  24.28 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  26.38 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  23.99 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  24.05 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  24.9 
 
 		 319 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  24.54 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  26.45 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  25.86 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.07 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  22.48 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  22.33 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  24.31 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  24.82 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  27.9 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  29.89 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  29.89 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  24.06 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  25.66 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  31.07 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 461 aa  67.4  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 471 aa  67  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 		 357 aa  67  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  29.48 
 
 		 1039 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 1005 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  24.53 
 
 		 561 aa  66.2  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>