More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2677 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 464 aa  968    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  38.91 
 
 		 468 aa  365  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  39.78 
 
 		 462 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  34.98 
 
 		 486 aa  336  5e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 518 aa  169  8e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  29.83 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 474 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  28.65 
 
 		 477 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 485 aa  131  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  30.45 
 
 		 728 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 		 460 aa  126  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 453 aa  120  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 465 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 458 aa  120  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  25.07 
 
 		 484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  26.65 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  29.23 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  26.53 
 
 		 470 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  24.49 
 
 		 476 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 476 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 489 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  26.59 
 
 		 476 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 476 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 460 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 		 447 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  29.83 
 
 		 452 aa  109  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  21.7 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 453 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  31.67 
 
 		 440 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  32.29 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 351 aa  100  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 		 403 aa  99.8  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4244  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 		 369 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 477 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  25.38 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 443 aa  90.9  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  31.72 
 
 		 432 aa  90.9  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  32.07 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  34.9 
 
 		 365 aa  89  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 		 460 aa  88.2  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  34.67 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 		 290 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  30.9 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  34.84 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  34.73 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  29.65 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 		 281 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  32.89 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0783  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  31.91 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  31.91 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  31.91 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 		 385 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 450 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  31.91 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  36.05 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  30.19 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  33.75 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  31.72 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  31.94 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  31.72 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  31.72 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  33.54 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  31.25 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  30.56 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  31.08 
 
 		 507 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  30.56 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  30.56 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  30.56 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  30.34 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  31.33 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  33.77 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>