More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2981 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  100 
 
 
477 aa  969    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  58.69 
 
 
476 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  58.69 
 
 
476 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  58.69 
 
 
476 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  60.63 
 
 
476 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  58.69 
 
 
476 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  57.14 
 
 
477 aa  567  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  55.91 
 
 
485 aa  553  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  35.71 
 
 
484 aa  296  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  31.97 
 
 
470 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 
460 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 
460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
447 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  30.6 
 
 
473 aa  171  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  26.17 
 
 
450 aa  170  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 
461 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  32.1 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 
453 aa  166  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 
462 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 
457 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 
456 aa  161  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  31.49 
 
 
458 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 
450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  25.78 
 
 
450 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  26.84 
 
 
489 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 
463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 
489 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  28.5 
 
 
465 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.48 
 
 
447 aa  138  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 
452 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 
476 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 
439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  27.66 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  27 
 
 
486 aa  120  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 
518 aa  118  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 
464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  26.93 
 
 
457 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 
430 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  24.39 
 
 
403 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  29.76 
 
 
470 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 
728 aa  103  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  26 
 
 
462 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 
468 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  34.71 
 
 
464 aa  97.8  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  27.69 
 
 
473 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
471 aa  96.7  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  21.83 
 
 
481 aa  93.2  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 
474 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 
484 aa  88.2  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  28.01 
 
 
432 aa  87.8  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  22.61 
 
 
460 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 
365 aa  84  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  34.31 
 
 
436 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 
487 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  34.04 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  31.97 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  29.35 
 
 
433 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  35.33 
 
 
367 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4244  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 
369 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  25.96 
 
 
481 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  23.06 
 
 
435 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  34.16 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  23.06 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  26.1 
 
 
346 aa  77  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  26.34 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 
440 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  23.39 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 
455 aa  75.9  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  23.13 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  25.7 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  25 
 
 
446 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  38.76 
 
 
344 aa  74.3  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  23.47 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  33.1 
 
 
438 aa  73.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  22.94 
 
 
369 aa  73.2  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 
496 aa  72.8  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  26.43 
 
 
450 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  27.1 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 
403 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  25.45 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 
467 aa  70.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  22.86 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  28.11 
 
 
510 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 
356 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  33.57 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  34.29 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  33.57 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  33.57 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  25.68 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>