More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1741 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 728 aa  1483    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  29.49 
 
 		 461 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 		 450 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 489 aa  124  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 453 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4244  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 369 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 		 460 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 434 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  26.68 
 
 		 450 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 458 aa  115  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 452 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  25.45 
 
 		 473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 		 486 aa  109  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 		 476 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  29.83 
 
 		 462 aa  108  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  29.24 
 
 		 481 aa  107  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  29.26 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 476 aa  105  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 485 aa  105  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  31.33 
 
 		 457 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  31.33 
 
 		 450 aa  103  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  28.61 
 
 		 351 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  25.82 
 
 		 477 aa  100  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 456 aa  99.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  43.12 
 
 		 468 aa  99.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 436 aa  97.8  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 477 aa  97.4  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 464 aa  97.1  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  25.14 
 
 		 484 aa  96.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 400 aa  96.3  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 476 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 476 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 476 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 460 aa  94.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 476 aa  94  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 394 aa  93.6  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 462 aa  93.2  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  27.39 
 
 		 474 aa  93.2  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 452 aa  91.7  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 440 aa  90.9  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  24.76 
 
 		 432 aa  90.5  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 465 aa  89.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 		 447 aa  89.4  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  21.8 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  20.92 
 
 		 430 aa  84  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  32.47 
 
 		 281 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 518 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  22.96 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  32.19 
 
 		 446 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  23.77 
 
 		 463 aa  77  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  28.45 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 499 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 450 aa  73.6  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 317 aa  73.9  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 445 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 		 434 aa  73.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  25.15 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 507 aa  71.2  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  24.61 
 
 		 453 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  23.87 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 450 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 459 aa  67  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  25.18 
 
 		 1000 aa  67  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 383 aa  67.4  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  22.7 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  26.21 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  26.47 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  34.44 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  32.67 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  34.44 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  26.53 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  21.98 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  25.11 
 
 		 393 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  26.94 
 
 		 399 aa  63.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>