More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4492 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 460 aa  965    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  59.51 
 
 		 470 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  30.56 
 
 		 484 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  31.16 
 
 		 477 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  28.63 
 
 		 476 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  28.64 
 
 		 476 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  28.64 
 
 		 476 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 476 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  34.27 
 
 		 458 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 476 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  33.13 
 
 		 473 aa  193  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  29.18 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 		 476 aa  188  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 		 460 aa  186  9e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  30.05 
 
 		 456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  27.59 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 452 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 		 489 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 489 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 457 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 450 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  28.4 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  28.91 
 
 		 447 aa  151  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 462 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  28.45 
 
 		 463 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 		 492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 		 430 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  31.69 
 
 		 465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  28.07 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 462 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  29.18 
 
 		 464 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  28.7 
 
 		 473 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 728 aa  94.7  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 		 436 aa  93.2  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  26.63 
 
 		 481 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 471 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 470 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  28.02 
 
 		 275 aa  91.3  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  25.28 
 
 		 457 aa  89.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 290 aa  89.4  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  31.85 
 
 		 518 aa  89  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  21.34 
 
 		 455 aa  87.8  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  26.22 
 
 		 432 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 		 394 aa  86.7  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 		 474 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  24.3 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  32.51 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  25.92 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  26.72 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  22.75 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  24.62 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0782  Radical SAM domain protein  21.37 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  23.32 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.15 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  24.48 
 
 		 394 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.15 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  25 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  23.66 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  23.62 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>