More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0109 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 465 aa  974    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  43.35 
 
 		 463 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  40.74 
 
 		 462 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  34.15 
 
 		 492 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 		 453 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  33.59 
 
 		 461 aa  216  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  29.83 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  32.33 
 
 		 450 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  30.21 
 
 		 476 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  33.84 
 
 		 484 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  30.89 
 
 		 450 aa  192  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 		 452 aa  190  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  31.2 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 		 489 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  28.12 
 
 		 473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  30.75 
 
 		 476 aa  179  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 		 489 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  31.57 
 
 		 476 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 476 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  31.39 
 
 		 476 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 		 476 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  28.47 
 
 		 477 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  32.14 
 
 		 470 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 453 aa  150  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  31.69 
 
 		 460 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  28.75 
 
 		 477 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 430 aa  123  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 403 aa  123  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 518 aa  120  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  25.58 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  31.15 
 
 		 464 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  39.22 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  28.75 
 
 		 290 aa  114  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  39.13 
 
 		 474 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  25.8 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 		 455 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 507 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 365 aa  94  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 400 aa  94  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 		 436 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 463 aa  90.9  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 		 440 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 463 aa  90.9  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  34.12 
 
 		 481 aa  89.7  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 		 728 aa  88.6  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 470 aa  88.2  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 344 aa  88.2  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  32.88 
 
 		 481 aa  87  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  33.58 
 
 		 281 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  23.77 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  22.49 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 800 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  34.29 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  34.29 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  34.29 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  34.29 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  31.33 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  22.76 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4244  Radical SAM domain protein  24.65 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  25 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  25 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.01 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  33.57 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 		 484 aa  77  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  33.82 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  24.12 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  22.2 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  32.73 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  23.75 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>