More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0685 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  67.7 
 
 		 507 aa  661    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 499 aa  1012    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  26.1 
 
 		 476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 452 aa  113  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  23.06 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 492 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  29.85 
 
 		 470 aa  100  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 462 aa  100  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  22.31 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  21.67 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  21.56 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.49 
 
 		 452 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  22.07 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 456 aa  95.1  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  21.84 
 
 		 489 aa  94.4  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 463 aa  93.2  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 470 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  23.48 
 
 		 429 aa  90.9  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  26.4 
 
 		 473 aa  87.8  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  21.28 
 
 		 447 aa  87.4  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  22.51 
 
 		 489 aa  87.4  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 465 aa  86.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  25.69 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  21.97 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  22.64 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  22.64 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  24.65 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  21.88 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  23.9 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 		 496 aa  76.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 728 aa  75.1  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  23.14 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 1000 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  22.38 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  24.11 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 		 1002 aa  72.8  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1560  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0307632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  23.86 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  23.54 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 		 487 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  35.43 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  23.4 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  25.06 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  22.55 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  23.29 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  22.55 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  22.55 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  23.36 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  19.64 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 		 518 aa  68.2  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  23.01 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  29.24 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 1005 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  23.5 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 403 aa  66.6  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 516 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 		 365 aa  66.6  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 466 aa  66.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  22.76 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  20.92 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  31.97 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  20.32 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  26.35 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0609  radical SAM domain-containing protein  25.92 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  20.65 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  20.65 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  20.65 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  20.65 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  20.65 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  20.11 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  22.87 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  21.21 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  22.48 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  23.72 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>