More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0479 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 471 aa  986    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  58.79 
 
 		 473 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  57.8 
 
 		 457 aa  550  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  53.95 
 
 		 470 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  25.49 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 		 461 aa  99.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  24.49 
 
 		 489 aa  96.3  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  26.47 
 
 		 470 aa  93.6  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  22.09 
 
 		 447 aa  93.6  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 458 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 460 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  22.8 
 
 		 370 aa  91.3  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 450 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 		 460 aa  89  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 402 aa  87.8  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 800 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 		 452 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  22.83 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 476 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 		 476 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  24.11 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.46 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  24.58 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  21.88 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  23.59 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  24.08 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  24.08 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 414 aa  79.7  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  23.33 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0156  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1467  Radical SAM domain protein  23.87 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1494  Radical SAM domain protein  23.87 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  21.91 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  24.11 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  23.74 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  22.91 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  23.21 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  21.32 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  21.32 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  21.32 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  21.32 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  25.35 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  23.06 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  21.57 
 
 		 385 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  21.32 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  23.97 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  24.41 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  21.12 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  21.29 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  24.85 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  24.07 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  21.32 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  23.2 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  24.58 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  22.97 
 
 		 383 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  24.17 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.74 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  23 
 
 		 280 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  22.43 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.74 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 465 aa  70.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.74 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.45 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>