More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1133 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 453 aa  941    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  31.33 
 
 		 325 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  29.07 
 
 		 367 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  26.18 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 496 aa  114  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  30.13 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.93 
 
 		 390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  27.76 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.17 
 
 		 380 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 412 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  26.17 
 
 		 410 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.17 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  26.25 
 
 		 373 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  36.21 
 
 		 387 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  32.76 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 377 aa  106  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  28.75 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  28.05 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  27.47 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  36.21 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 		 440 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.53 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 406 aa  104  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.3 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 347 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 406 aa  103  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 460 aa  103  9e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  26.1 
 
 		 444 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 		 349 aa  103  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.99 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  32.18 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  27.93 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 		 334 aa  100  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 381 aa  100  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  30.89 
 
 		 393 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.81 
 
 		 349 aa  98.6  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  27.48 
 
 		 470 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  27.83 
 
 		 330 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  25.72 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  28.43 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  25.07 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.8 
 
 		 399 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 		 391 aa  97.8  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 429 aa  97.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 330 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 1000 aa  97.1  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  26.54 
 
 		 561 aa  96.7  7e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 398 aa  97.1  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.77 
 
 		 346 aa  96.3  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  29.54 
 
 		 360 aa  96.3  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4243  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 360 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 333 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 391 aa  96.3  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 		 382 aa  96.3  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 		 414 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 460 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.34 
 
 		 335 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  24.93 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 		 347 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 411 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 411 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  32.95 
 
 		 413 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  27.48 
 
 		 366 aa  94.7  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  24.93 
 
 		 411 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 394 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  32.07 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 452 aa  94  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 381 aa  94  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  26.56 
 
 		 510 aa  94  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  24.93 
 
 		 411 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  27.38 
 
 		 769 aa  93.6  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  24.93 
 
 		 411 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.58 
 
 		 398 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  26.67 
 
 		 332 aa  93.6  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>