More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1665 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 438 aa  911    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 		 363 aa  143  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  28.37 
 
 		 561 aa  136  7.000000000000001e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.8 
 
 		 397 aa  130  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  26.72 
 
 		 359 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  28.45 
 
 		 479 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  23.23 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 496 aa  127  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 377 aa  127  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 358 aa  127  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 501 aa  127  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  27.78 
 
 		 349 aa  126  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.91 
 
 		 330 aa  123  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  28 
 
 		 366 aa  122  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 327 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 333 aa  121  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 399 aa  121  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 		 358 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  26.05 
 
 		 356 aa  120  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  25.66 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  27.41 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 334 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  28.74 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  28.89 
 
 		 769 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  27.38 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  27.19 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  23.17 
 
 		 347 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.42 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.77 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 384 aa  114  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  25.92 
 
 		 358 aa  113  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28.69 
 
 		 565 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 354 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 		 389 aa  112  9e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 		 480 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 378 aa  110  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 332 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 407 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  24.15 
 
 		 410 aa  106  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 404 aa  106  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 381 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  34.21 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  34.62 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  34.62 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  25.66 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 427 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  30.2 
 
 		 387 aa  103  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  24.27 
 
 		 359 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  33.52 
 
 		 387 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 360 aa  103  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.93 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  33.33 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4646  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 371 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  32.07 
 
 		 379 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.78 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  31.22 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  25.71 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  30.65 
 
 		 418 aa  99.8  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  31.47 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.09 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 316 aa  99  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  26.55 
 
 		 355 aa  97.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  24.7 
 
 		 358 aa  97.1  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 396 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 		 380 aa  96.7  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  30.05 
 
 		 387 aa  96.7  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 417 aa  96.7  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  0.0000106904 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  25.77 
 
 		 422 aa  96.7  8e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  24.42 
 
 		 487 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>