More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1519 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 422 aa  855    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 427 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 347 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  28.2 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  28.01 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  25.33 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  27.16 
 
 		 401 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 401 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  27.16 
 
 		 401 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 		 405 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 		 429 aa  106  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  26.65 
 
 		 561 aa  104  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  27.68 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  28.47 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 800 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  33.7 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 		 317 aa  100  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 		 363 aa  100  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.65 
 
 		 380 aa  100  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.51 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  33.93 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 		 496 aa  99.4  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  31.39 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 418 aa  99  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  31.39 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0609  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 384 aa  97.1  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 440 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  24.28 
 
 		 399 aa  96.7  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 377 aa  96.3  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 438 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  26.99 
 
 		 337 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.35 
 
 		 346 aa  94  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.89 
 
 		 380 aa  93.2  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 330 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  24.46 
 
 		 349 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  26.67 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 325 aa  90.1  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 389 aa  90.1  6e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 428 aa  90.1  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  22.65 
 
 		 479 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  31.68 
 
 		 418 aa  89  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  24.62 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  28.49 
 
 		 769 aa  88.6  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 323 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 		 377 aa  87  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 407 aa  87.4  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  25.66 
 
 		 376 aa  86.7  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.49 
 
 		 340 aa  86.7  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0378398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 347 aa  86.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  24.84 
 
 		 335 aa  86.3  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  30.81 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.2 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  27.62 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  28.85 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 1005 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  29.36 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 		 330 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0544  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.07 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  31.69 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  27.66 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 1000 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  31.53 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.94 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000120862  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.94 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0835  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.94 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.344402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1320  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.47 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00765  hypothetical protein  25.94 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0844  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.94 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0987442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0929  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.94 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  29.41 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3986  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0863511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2862  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.94 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0111085  normal  0.0131262 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.94 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>