More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1580 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 429 aa  870    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  29.72 
 
 		 415 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  30.88 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 800 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 496 aa  106  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  28.92 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 565 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  22.06 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  27.3 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.93 
 
 		 479 aa  93.2  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 499 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 381 aa  90.5  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  26.05 
 
 		 510 aa  90.1  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 366 aa  89.7  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 465 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  22.04 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  24.05 
 
 		 330 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  24.36 
 
 		 349 aa  86.7  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  24.32 
 
 		 561 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 323 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  23.49 
 
 		 347 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  24.48 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0609  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  23.1 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  25.22 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  23.98 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  25.77 
 
 		 357 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  23.56 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  23.66 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  24.27 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  26.8 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  24.3 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 		 480 aa  79.7  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 317 aa  79.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 358 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  25.7 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 349 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0292  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.42 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.876947 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  25.5 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.56 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  24.41 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.33 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  26.62 
 
 		 769 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  23.25 
 
 		 507 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  21.73 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  22.82 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  22.87 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.81 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2175  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  22.02 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.43 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  22.13 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 1005 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.45 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  23.03 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  25.08 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  25.94 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  26.77 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2033  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.28 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6512  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.21 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397453  normal  0.0847554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  24.11 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2470  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.85 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616066 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  24.64 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>