288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0602 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  100 
 
 		 280 aa  571  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  95 
 
 		 370 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  50.36 
 
 		 368 aa  291  6e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  42.7 
 
 		 369 aa  244  9e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  43.46 
 
 		 370 aa  240  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  40.71 
 
 		 374 aa  229  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  38.99 
 
 		 402 aa  215  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  34.66 
 
 		 367 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  35.64 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  35.64 
 
 		 398 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  35.64 
 
 		 398 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  35.64 
 
 		 398 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  35.29 
 
 		 398 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  35.36 
 
 		 393 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  34.88 
 
 		 383 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  35.54 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  36.36 
 
 		 391 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 391 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  36.36 
 
 		 391 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  35.54 
 
 		 385 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  35.54 
 
 		 385 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  35.54 
 
 		 385 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  35.54 
 
 		 385 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  35.54 
 
 		 385 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  35.54 
 
 		 385 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  35.54 
 
 		 385 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  35.37 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  38.13 
 
 		 397 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  32.67 
 
 		 444 aa  178  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  34.25 
 
 		 411 aa  178  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  33.56 
 
 		 411 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  33.77 
 
 		 431 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  33.56 
 
 		 411 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  33.56 
 
 		 411 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  33.22 
 
 		 411 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  33.22 
 
 		 411 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  33.56 
 
 		 411 aa  175  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  33.22 
 
 		 411 aa  175  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  33.9 
 
 		 411 aa  175  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  32.4 
 
 		 438 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  35.23 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  33.33 
 
 		 447 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  33.67 
 
 		 408 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  33.67 
 
 		 408 aa  168  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  33.67 
 
 		 408 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  32.99 
 
 		 431 aa  167  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  32.89 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  32.89 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  32.99 
 
 		 431 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  33.12 
 
 		 440 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  34.83 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  32.12 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  30.46 
 
 		 433 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 		 435 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  34.48 
 
 		 395 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  34.48 
 
 		 396 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  34.48 
 
 		 395 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  32.12 
 
 		 435 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  33.1 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  32.66 
 
 		 407 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  31.51 
 
 		 414 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.93 
 
 		 394 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  31.63 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  31.63 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.93 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.93 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  28.57 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 366 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 383 aa  105  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  27.95 
 
 		 393 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  25.1 
 
 		 391 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  24.72 
 
 		 380 aa  96.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 403 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 402 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  26.07 
 
 		 460 aa  95.5  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 385 aa  92.8  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  24.33 
 
 		 387 aa  92  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 401 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 414 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2479  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 436 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.657358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  25.35 
 
 		 399 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2577  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 436 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3003  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 436 aa  90.1  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00234995  hitchhiker  0.0000159012 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  24.34 
 
 		 381 aa  89.7  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  25.27 
 
 		 723 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 		 418 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2654  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 781 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0138301 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  22.85 
 
 		 389 aa  85.9  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  21.6 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  22.66 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  20.15 
 
 		 800 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1494  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1467  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>