More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0069 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  100 
 
 
452 aa  932    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  56.15 
 
 
450 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  49.78 
 
 
489 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  50.11 
 
 
461 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  50.68 
 
 
450 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  49.45 
 
 
473 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  47.31 
 
 
476 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  49.66 
 
 
447 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  48 
 
 
456 aa  428  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  45.41 
 
 
457 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  45.75 
 
 
450 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  44.74 
 
 
453 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  45.39 
 
 
460 aa  412  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  46.64 
 
 
452 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  45.45 
 
 
458 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  42.96 
 
 
489 aa  361  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  30.41 
 
 
484 aa  190  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 
460 aa  180  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  30.12 
 
 
470 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  28.19 
 
 
462 aa  178  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  28.79 
 
 
463 aa  171  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  27.84 
 
 
477 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  29.51 
 
 
453 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 
492 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 
476 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 
485 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  25.45 
 
 
476 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 
465 aa  146  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 
439 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 
476 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 
476 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 
476 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  28.61 
 
 
403 aa  136  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 
430 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 
477 aa  117  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
728 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 
460 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 
468 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  24.49 
 
 
486 aa  103  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 
463 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 
463 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 
434 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  22.71 
 
 
462 aa  97.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 
443 aa  96.7  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 
467 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  23.49 
 
 
499 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 
436 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 
365 aa  94.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  25.46 
 
 
518 aa  93.6  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 
429 aa  93.2  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  24.37 
 
 
432 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 
486 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 
434 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 
487 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  26.3 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  26.6 
 
 
446 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 
415 aa  89  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 
450 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 
459 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
455 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 
470 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  30.72 
 
 
464 aa  84  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 
484 aa  83.6  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 
510 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 
471 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 
507 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 
385 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  27.3 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  23.24 
 
 
447 aa  80.5  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
323 aa  80.5  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 
800 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  24.2 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  24.59 
 
 
483 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 
383 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 
387 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  24.41 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.37 
 
 
394 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.37 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  25.63 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.6 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 
402 aa  77  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.37 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 
394 aa  76.3  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  23.88 
 
 
481 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0783  Radical SAM domain protein  23.5 
 
 
469 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0782  Radical SAM domain protein  23.83 
 
 
510 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  24.17 
 
 
481 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 
468 aa  75.1  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  23.83 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 
464 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>