More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1754 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 447 aa  913    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  30.16 
 
 		 463 aa  180  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  32.1 
 
 		 447 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  28.17 
 
 		 450 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 458 aa  169  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  32.19 
 
 		 461 aa  169  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  30.84 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 		 476 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  31.67 
 
 		 489 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 		 489 aa  162  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 		 453 aa  161  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 		 439 aa  160  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  28.73 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  25.25 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  30.68 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 		 450 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 		 460 aa  151  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  28.91 
 
 		 460 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  26.2 
 
 		 470 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  26.38 
 
 		 477 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  26.65 
 
 		 476 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 476 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  28.69 
 
 		 485 aa  139  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  27.58 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 		 476 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  22.8 
 
 		 477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 468 aa  120  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 486 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  33.89 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  29.43 
 
 		 351 aa  108  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 463 aa  107  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  40.4 
 
 		 518 aa  106  7e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 443 aa  100  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 436 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  32.36 
 
 		 290 aa  98.2  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  24.58 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  22.09 
 
 		 471 aa  93.6  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  36.52 
 
 		 474 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 356 aa  90.9  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 460 aa  90.5  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  25.2 
 
 		 432 aa  90.5  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 		 728 aa  89.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 		 369 aa  88.2  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 356 aa  88.2  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 510 aa  86.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 		 453 aa  86.7  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  26.21 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  22.41 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 481 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  25.48 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  23.69 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  24.44 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  24.44 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  24.03 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  32.68 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  23.8 
 
 		 415 aa  83.2  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.45 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  23.08 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  25.35 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  25.53 
 
 		 367 aa  79.7  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  24.01 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  22.32 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  23.02 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  25.68 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  22.55 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  26.3 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  22.84 
 
 		 800 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  26.3 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>